Το λιμάνι των Σπηλιών αποτελεί το θαλάσσιο επίνειο του Σπαρτοχωρίου, σε προστατευμένο όρμο στη βορειοδυτική πλευρά του Μεγανησίου. Διαθέτει προβλήτες και υποδομές για επιβατικά και ιδιωτικά σκάφη και συνδέεται άμεσα με τον οικισμό.
Οργανωμένη μαρίνα στον προστατευμένο κόλπο του Βαθέος, με θέσεις ελλιμενισμού και υποδομές εξυπηρέτησης σκαφών αναψυχής. Βρίσκεται δίπλα στον οικισμό και αποτελεί μέρος της ναυτικής και τουριστικής υποδομής του Μεγανησίου.
Παραθαλάσσιος οικισμός στον προστατευμένο κόλπο του Βαθέος, με λιμάνι, προκυμαία, ψαροταβέρνες και τουριστική μαρίνα. Η ναυτική δραστηριότητα αποτελεί βασικό στοιχείο της ταυτότητάς του και συνδέεται με την καθημερινή ζωή και τον θαλάσσιο τουρισμό του Μεγανησίου.
Παραθαλάσσιος οικισμός στη βορειοανατολική Ιθάκη, χτισμένος γύρω από φυσικό λιμάνι με έντονη δραστηριότητα σκαφών. Οι δύο ανεμόμυλοι, η παραθαλάσσια εστίαση και η πρόσβαση σε κοντινές παραλίες και θαλάσσιες διαδρομές αποτελούν βασικά στοιχεία της επίσκεψης.